Génomique fonctionnelle

La génomique fonctionnelle est une nouvelle discipline qui a émergé dans le prolongement du décryptage des génomes et dont l’objet est la compréhension du fonctionnement de la cellule. La connaissance du génome complet d’un organisme permet d’établir le catalogue des gènes dont cet organisme dispose pour faire fonctionner ses cellules. Chaque gène peut être considéré comme une pièce détachée et chaque cellule comme une usine dont le fonctionnement dépend non seulement des propriétés de chacune des pièces mais aussi et surtout de la façon dont celles-ci interagissent et/ou s’assemblent. De la même façon, les fonctions cellulaires sont assurées par des réseaux de protéines codées par des gènes dont l’expression est régulée de façon coordonnée.

Pour caractériser la fonction de chaque gène et reconstituer la nature des réseaux moléculaires (interactions entre les protéines et/ou entre les protéines et l'ADN) responsables des fonctions biologiques, la génomique fonctionnelle s’appuie sur le développement et la mise en œuvre d’une variété de technologies sans cesse innovées. Il s’agit notamment de technologies dites à haut débit telles que les puces à ADN qui permettent d’étudier simultanément l’expression d’un grand nombre de gènes. L’application de ces nouvelles approches expérimentales génère des quantités très importantes de données dont la gestion et l’interprétation nécessitent la mise au point de nouveaux programmes ce qui constitue le champs d’application principales de la BioInformatique.

Bioinformatique

Le développement de programmes informatiques dédiés à l’analyse des données biologiques n’est pas une activité récente. Ce domaine scientifique a cependant connu un développement spectaculaire depuis le milieu des années 90 et qui coïncide avec le décryptage à grande échelle des génomes. C’est à ce moment là que le terme « Bioinformatique » apparaît dans la littérature scientifique. Pour permettre la gestion et l’exploitation des données génomique les nouvelles méthodes bioinformatiques s’efforcent en particulier d’aider les biologistes à faire le lien entre l’information moléculaire (gènes, protéines) et les fonctions biologiques. Les travaux de recherche en bioinformatiques sont au cœur du développement de la "génomique fonctionnelle".