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La PCR est l’abréviation anglophone de « Polymerase Chain Reaction ». C’est une technique de biologie moléculaire permettant l’amplification d’une partie spécifique d’acide nucléique connue (ADN ou ARN). Cette technique a la particularité d’utiliser une très faible quantité d’acide nucléique (de l’ordre du nanogramme) et d’arriver à une quantité relativement importante (facteur de multiplication de l'ordre du million). Une PCR se déroule en 4 étapes.
Activation de l’enzyme – 5 à 15 min à 95°CL’ADN polymérase est protégée par un anticorps sensible à la chaleur dit « thermolabile ». Cet anti corps protège l’enzyme et permet de contrôler le départ de la réaction. Cette étape est maintenant nécessaire pour la quasi totalité des ADN polymérase, on appelle ces enzymes des « hot-start »Dénaturation d’ADNCette étape sépare les 2 brins complémentaires de l’ADN génomique, elle se déroule la plus part du temps entre 93 et 98 °C pendant 30 s à 2 min. Elle est indispensable pour l'étape « d'hybridation ». L'hybridationC’est à cette étape que chacune des 2 amorces va se fixer sur son brin d'ADN génomique. C'est grâce à leur petite taille que les amorces s'hybrident avant le réappariment des 2 brins d'ADN génomique complémentaires. Elle est réalisée proche des températures d'hybridation des 2 amorces, souvent entre 50 et 60°C et dure 30 à 45 secondes. Cette température d'hybridation des amorces est dépendante de la composition et peut être calculée par la formule suivante: Tm = 2x(A+T)+ 4x(G+C)] ElongationC’est la phase où l’ADN polymérase se fixe sur l'amorce hybridée et synthétise un brin d’ADN complémentaire de l'ADN génomique. La synthèse se fait dans le sens 5' --> 3' par rapport à l'amorce .L'étape dure entre 15s et 2 min à 72 °C. L'ensemble des étapes 2 à 4 est appelé cycle. Pour obtenir une quantité significative d'ADN amplifié, il faut réaliser 25 à 40 cycles.Ces étapes sont automatisées dans une machine appelée thermocycleur. A chaque cycle, le nombre de copies présentes est doublé. La PCR nécessite l'utilisation de différents réactifs
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